Главная / Карточка организации/ Карточка вакансии

Вакансия ID VAC_96936

статус: ПРИЕМ ЗАЯВОК
начало приема заявок: 08.08.2022 09:00
окончание приема заявок: 30.08.2022 17:00
дата проведения конкурса: 14.09.2022 11:00
Организация:
Федеральное государственное бюджетное учреждение "Национальный медицинский исследовательский центр гематологии" Министерства здравоохранения Российской Федерации
Должность:
Заведующий (начальник) научно-исследовательского отдела (лаборатории)
«ЗАВЕДУЮЩИЙ лабораторией эпигенетической регуляции кроветворения»
Отрасль науки:
Биологические науки
Деятельность:
Передача опыта научной деятельности и воспроизводство научных кадров
Трудовые функции:
Обобщение научных (научно-технических) результатов, полученных в процессе решения научно-исследовательских задач научными коллективами
Трудовая деятельность:
Проводить исследования, эксперименты, наблюдения, измерения на основе методики, предложенной ответственным исполнителем
Формулировать выводы и основные результаты исследований, экспериментов, наблюдений, измерений
Анализировать научную и (или) научно-техническую информацию, необходимую для решения отдельных задач исследования
Разрабатывать методики решения отдельных задач исследования
Проводить научную экспертизу законченных исследований.
Определять варианты практического применения и формы доведения до всеобщего сведения научных (научно-технических) результатов
Проводить экспертизу исследовательских программ
Для выполнения вышеуказанных трудовых действий необходимо: иметь опыт руководства научным коллективом для выполнения научно-исследовательской работы (НИР); обосновывать актуальность и новизну темы научного исследования. Формулировать основную гипотезу исследования; координировать решение задач исследования в процессе его проведения; обобщать результаты, полученные в процессе решения задач исследования; обобщать информацию о научных и (или) научно-технических результатах, полученных в соответствующей области исследований; наличие опубликованных статей в отечественных и зарубежных журналах; опыт в подготовке докладов для всероссийских и международных конференций; опыт формирования документации для подачи заявок на получение научных грантов; опыт руководства проведением магистерских и аспирантских диссертационных работ; опыт работы по привлечению магистрантов и аспирантов к решению отдельных задач исследования, в том числе по инициативным тематикам; опыт рецензирования кандидатских диссертаций; научные статьи, доклады, обзоры и другие публикуемые научные материалы, опыт выступления оппонентом при защите кандидатских диссертаций; владение традиционными методами молекулярной биологии: выделение ДНК и РНК из бактерий и эукариотических клеток и тканей, в том числе из высокоминерализованных (кости) и соединительно-тканных (мышцы), традиционная ПЦР с детекцией по конечной точке, ПЦР в режиме реального времени, цифровая ПЦР, цифровая капельная ПЦР, электрофорез нуклеиновых кислот и белков, секвенирование ДНК по Сэнгеру; владение традиционными методами генной инженерии – получение и трансдукция компетентных клеток, индукция экспрессии целевых генов, культивирование бактерий в жидких и полужидких средах, анализ эффективности трансдукции по lacZ-тесту, выделение белка и ДНК из бактерий. Обладать навыками одновременного определения концентрации цитокинов в плазме и сыворотке крови с помощью иммунофлуоресцентного анализа на платформе BioRad Bioplex; иметь навыки подготовки библиотек ДНК для высокопроизводительной параллельной ПЦР нового поколения (NGS), в том числе проводить фрагментацию ДНК с помощью ультразвука, фрагментный анализ, энзиматическую подготовку концов, легирование фрагментов ДНК, обогащение целевыми последовательностями, очистку библиотеки, высокоточное измерение концентрации ДНК с помощью калориметрических методов и методов, основанных на ПЦР, равномерное пулирование библиотек, обладать опытом запуска секвенаторов платформы Illumina; иметь навыки анализа первичной последовательности геномной ДНК и создания праймеров и зондов для проведения различных видов ПЦР; владеть основными методами клеточной биологии: ведение культур эукариотических клеток, в частности мультипотентных мезенхимных клеток (ММСК) человека, длительных культур костного мозга декстеровского типа, и других; иметь опыт применения проточной многоцветной цитофлуориметрии для анализа клеточных субпопуляций, иметь опыт применения иммунофлуоресцентного анализа. Обладать навыками использования микроскопов, в том числе флуоресцентных; иметь опыт в применении комплексных молекулярно-биологических и клеточных методов, таких как трансдукция эукариотических клеток, в частности ММСК, лентивирусными векторами, с последующим анализом сайтов интеграции в клонах и в суммарной культуре с помощью ПЦР опосредованной лигированием (LAM-PCR, LM-PCR), с помощью методов высокопроизводительного параллельного секвенирования (NGS). Обладать знаниями и умениями в биоинформатике для решения широкого круга задач, таких как: Контроль качества данных NGS; анализ данных полногеномного и полноэкзомного секвенирования. Филогенетика и анализ WGS эукариот - Функциональная аннотация и определение патогенности мутации. PolyPhen-2, SIFT, VEP и другие. Сборка геномов и транскриптомов; метагеномика - Методы профилирования состава микробиома на основании NGS; предобработка ридов и таксономическая классификация 16S рРНК/ITS данных (QIIME2, DADA2, Deblur). Определение состава сообщества по shotgun-метагеномам; Hi-C метагеномика. Анализ метилирования ДНК: Методы анализа метилирования ДНК; Бисульфитная конверсия; WGBS, RRBS и другие; анализ данных бисульфитного секвенирования. Дифференциальное метилирование. РНК-секвенирование: Сборка транскриптов. Квантификация (htseq-count, stringtie, etc); проверка самосогласованности: корреляционная тепловая карта, PCA/MDS, t-test, поправка на множественное тестирование. lm/ANOVA, glm/ANODEV, нормализация; дифференциальная экспрессия (edgeR), дифференциальный сплайсинг (DEXseq, SAJR), функциональный анализ (topGO); визуализация данных РНК-секвенирования в IGV и при помощи R; кластеризация генов по паттернам; опыт анализа данных секвенирования единичных клеток: scRNA-Seq и snRNA-Seq: владеть основными методы подготовки библиотек scRNA-Seq: SMART-Seq и 10x Chromium; основной пайплайн обработки scRNA-Seq; дополнительные стадии обработки scRNA-Seq: CellPhoneDB, RNA velocity, определений траекторий и прочее; основные результаты в исследованиях опухолей при помощи scRNA-Seq; обладать навыками работы с лабораторными животными – инбредными линиями мышей C57Black/6J, C57Black/10J, Balb/c, F1 (CBA x C57Black/6J), трансгенными линиями B10.GFP и F1 (Nestin-GFP x C57Black/6J); обладать опытом генотипирования мышей, забора крови, выделения тканей и органов: костного мозга, костей, печени, селезенки, скелетных мышц, тимуса; владеть методом посадки очагов эктопического кроветворения под капсулу почки мыши.
Регион:
Москва
Населенный пункт:
Москва Москва

Требования к кандидату

Вакансия для выпускников вузов:
Нет
Результаты интеллектуальной деятельности:
публикации
Использование результов интеллектуальной деятельности:
Ученая степень и звание:
доктор биологических наук
Опыт развития организации:
подготовка магистров и аспирантов
подготовка кадров высшей квалификации
создание лабораторий
Прочие требования к кандидату:

Для выполнения вышеуказанных трудовых действий необходимо: иметь опыт руководства научным коллективом для выполнения научно-исследовательской работы (НИР); обосновывать актуальность и новизну темы научного исследования. Формулировать основную гипотезу исследования; координировать решение задач исследования в процессе его проведения; обобщать результаты, полученные в процессе решения задач исследования; обобщать информацию о научных и (или) научно-технических результатах, полученных в соответствующей области исследований; наличие опубликованных статей в отечественных и зарубежных журналах; опыт в подготовке докладов для всероссийских и международных конференций; опыт формирования документации для подачи заявок на получение научных грантов; опыт руководства проведением магистерских и аспирантских диссертационных работ; опыт работы по привлечению магистрантов и аспирантов к решению отдельных задач исследования, в том числе по инициативным тематикам; опыт рецензирования кандидатских диссертаций; научные статьи, доклады, обзоры и другие публикуемые научные материалы, опыт выступления оппонентом при защите кандидатских диссертаций; владение традиционными методами молекулярной биологии: выделение ДНК и РНК из бактерий и эукариотических клеток и тканей, в том числе из высокоминерализованных (кости) и соединительно-тканных (мышцы), традиционная ПЦР с детекцией по конечной точке, ПЦР в режиме реального времени, цифровая ПЦР, цифровая капельная ПЦР, электрофорез нуклеиновых кислот и белков, секвенирование ДНК по Сэнгеру; владение традиционными методами генной инженерии – получение и трансдукция компетентных клеток, индукция экспрессии целевых генов, культивирование бактерий в жидких и полужидких средах, анализ эффективности трансдукции по lacZ-тесту, выделение белка и ДНК из бактерий. Обладать навыками одновременного определения концентрации цитокинов в плазме и сыворотке крови с помощью иммунофлуоресцентного анализа на платформе BioRad Bioplex; иметь навыки подготовки библиотек ДНК для высокопроизводительной параллельной ПЦР нового поколения (NGS), в том числе проводить фрагментацию ДНК с помощью ультразвука, фрагментный анализ, энзиматическую подготовку концов, легирование фрагментов ДНК, обогащение целевыми последовательностями, очистку библиотеки, высокоточное измерение концентрации ДНК с помощью калориметрических методов и методов, основанных на ПЦР, равномерное пулирование библиотек, обладать опытом запуска секвенаторов платформы Illumina; иметь навыки анализа первичной последовательности геномной ДНК и создания праймеров и зондов для проведения различных видов ПЦР; владеть основными методами клеточной биологии: ведение культур эукариотических клеток, в частности мультипотентных мезенхимных клеток (ММСК) человека, длительных культур костного мозга декстеровского типа, и других; иметь опыт применения проточной многоцветной цитофлуориметрии для анализа клеточных субпопуляций, иметь опыт применения иммунофлуоресцентного анализа. Обладать навыками использования микроскопов, в том числе флуоресцентных; иметь опыт в применении комплексных молекулярно-биологических и клеточных методов, таких как трансдукция эукариотических клеток, в частности ММСК, лентивирусными векторами, с последующим анализом сайтов интеграции в клонах и в суммарной культуре с помощью ПЦР опосредованной лигированием (LAM-PCR, LM-PCR), с помощью методов высокопроизводительного параллельного секвенирования (NGS). Обладать знаниями и умениями в биоинформатике для решения широкого круга задач, таких как: Контроль качества данных NGS; анализ данных полногеномного и полноэкзомного секвенирования. Филогенетика и анализ WGS эукариот - Функциональная аннотация и определение патогенности мутации. PolyPhen-2, SIFT, VEP и другие. Сборка геномов и транскриптомов; метагеномика - Методы профилирования состава микробиома на основании NGS; предобработка ридов и таксономическая классификация 16S рРНК/ITS данных (QIIME2, DADA2, Deblur). Определение состава сообщества по shotgun-метагеномам; Hi-C метагеномика. Анализ метилирования ДНК: Методы анализа метилирования ДНК; Бисульфитная конверсия; WGBS, RRBS и другие; анализ данных бисульфитного секвенирования. Дифференциальное метилирование. РНК-секвенирование: Сборка транскриптов. Квантификация (htseq-count, stringtie, etc); проверка самосогласованности: корреляционная тепловая карта, PCA/MDS, t-test, поправка на множественное тестирование. lm/ANOVA, glm/ANODEV, нормализация; дифференциальная экспрессия (edgeR), дифференциальный сплайсинг (DEXseq, SAJR), функциональный анализ (topGO); визуализация данных РНК-секвенирования в IGV и при помощи R; кластеризация генов по паттернам; опыт анализа данных секвенирования единичных клеток: scRNA-Seq и snRNA-Seq: владеть основными методы подготовки библиотек scRNA-Seq: SMART-Seq и 10x Chromium; основной пайплайн обработки scRNA-Seq; дополнительные стадии обработки scRNA-Seq: CellPhoneDB, RNA velocity, определений траекторий и прочее; основные результаты в исследованиях опухолей при помощи scRNA-Seq; обладать навыками работы с лабораторными животными – инбредными линиями мышей C57Black/6J, C57Black/10J, Balb/c, F1 (CBA x C57Black/6J), трансгенными линиями B10.GFP и F1 (Nestin-GFP x C57Black/6J); обладать опытом генотипирования мышей, забора крови, выделения тканей и органов: костного мозга, костей, печени, селезенки, скелетных мышц, тимуса; владеть методом посадки очагов эктопического кроветворения под капсулу почки мыши.

Заработная плата

ДОЛЖНОСТНОЙ ОКЛАД:
128 915 руб.
СТАВКА:
1.0
СТИМУЛИРУЮЩИЕ ВЫПЛАТЫ:
0 руб.
ЕЖЕМЕСЯЧНОЕ ПРЕМИРОВАНИЕ:
0 руб.
ГОДОВОЕ ПРЕМИРОВАНИЕ:
0 руб.
УСЛОВИЯ ПРЕМИРОВАНИЯ:
высокая результативность работы (вклад в результативность организации)
организация создания или качественного развития инфраструктуры и информационного обеспечения исследований
организация и «запуск» новых научных или научно-технических проектов
привлечение и подготовка новых кадров высшей квалификации
ценность и востребованность результата (высокий объем цитирований, лицензирование прав на результат)
качество выполняемых исследований («уровень» публикации или патентование результата, в том числе за рубежом)

Социальный пакет

ЖИЛЬЕ:
ПРОЕЗД:
ОТДЫХ:
ежегодный основной отпуск
МЕДИЦИНСКОЕ ОБСЛУЖИВАНИЕ И СТРАХОВАНИЕ ОТ НЕСЧАСТНЫХ СЛУЧАЕВ НА ПРОИЗВОДСТВЕ:
СТАЖИРОВКИ И ПОВЫШЕНИЕ КВАЛИФИКАЦИИ:
ДРУГОЕ:

Контактная информация

ФАМИЛИЯ, ИМЯ, ОТЧЕСТВО:
Джулакян Унан Левонович
E-MAIL:
nauka@blood.ru
ТЕЛЕФОН:
+74956126463
ДОПОЛНИТЕЛЬНО:

loader
идёт загрузка