Определяет цели и стратегии развития научной, инновационной и издательской деятельности Института. Осуществляет контроль информационного и информационно-технологического обеспечения деятельности Института. Осуществляет обеспечение подведомственных структурных подразделений квалифицированными кадрами, формирование материально- технической базы с учетом достижений в области науки, использования новейших технологий и новейшей техники, обмена опытом, прогрессивных форм управления и организации труда, обоснованных норм расходования и рационального использования материальных и технических ресурсов. Обеспечивает выполнение структурными подразделениями Института коллективного договора и соблюдения трудовой дисциплины. Осуществляет создание условий, направленных на развитие трудовой мотивации, инициативы и активности работников. Осуществляет контроль за деятельностью научно-отраслевого архива и за библиотекой Института. Осуществляет руководство организационно-хозяйственной деятельностью Института в пределах своей компетенции.

Организация и осуществление общего руководства и выполнения плановых научно-исследовательских и других работ. Контроль за выполнением Институтом государственного задания в рамках фундаментальных программ. Обоснование направлений перспективных исследований, формирование планов научно-исследовательских работ. Проведение археологических полевых работ, включая спасательные археологические полевые работы. Разработка концепций реконструкции и музеефикации объектов археологического наследия.

Осуществление взаимодействия Института с внешними организациями и учреждениями. Разработка научных программ развития партнерских связей Института с научными и образовательными центрами. Разработка плана научных изданий и публикаций. Организация участия Института в конкурсах грантов, выставках, конференциях. Организация подготовки и проведения научных конференций, симпозиумов, семинаров и выставок, проводимых Институтом.