Федеральное государственное автономное научное учреждение «Федеральный научный центр исследований и разработки иммунобиологических препаратов им. М.П. Чумакова РАН» (институт полиомиелита)

Старший научный сотрудник

Биологические науки

Проведение исследования

Постановка задач исследования научному коллективу

Обосновывать актуальность и новизну темы исследования
Формулировать основную гипотезу исследования
Осуществлять декомпозицию цели исследования на отдельные задачи
Координировать решение задач исследования в процессе его проведения
Обобщать результаты, полученные в процессе решения задач исследования
Обобщать информацию о научных и (или) научно-технических результатах, полученных в соответствующей области исследований

Москва

посёлок Института Полиомиелита Москва

Нет

публикации

кандидат химических наук

1. опыт разработки многоступенчатых протоколов виртуального скрининга, включающих выбор вычислительного протокола, подготовку белковых мишеней, стандартизацию и очистку химических библиотек (фильтрация по физико-химическим свойствам, реакционной способности и нежелательным структурным мотивам), поиск структурных аналогов, лиганд-обоснованный и структурнообоснованный виртуальный скрининг, рескоринг, кластеризацию и выбор репрезентативных соединений для экспериментальной проверки; 2. уверенное владение инструментами хемоинформатики, включая RDKit; опыт работы с химическими библиотеками и анализа больших химических пространств (PCA, t-SNE, UMAP); 3. опыт построения и валидации моделей машинного обучения для задач медицинской химии, включая классическое и глубокое обсучение; 4. опыт вычислительной структурной биологии, включая анализ и подготовку экспериментальных структур из PDB, оценку качества белковых структур; моделирование по гомологии, анализ сайтов связывания, лиганд-белковых взаимодействий и фингерпринтов взаимодействия, использование PyMOL, UCSF ChimeraX, VMD и аналогичных средств визуализации; 5. уверенное программирование на Python с использованием NumPy, pandas, SciPy, scikit-learn, RDKit и PyTorch; способность самостоятельно разрабатывать специализированные пайплайны обработки химических и структурных данных; 6. опыт работы с SQL и реляционными базами данных, включая проектирование запросов для больших химических/биологических наборов данных, интеграцию структурных и экспериментальных данных и автоматизированное извлечение данных для вычислительных конвейеров; 7. опыт автоматизации вычислительных задач, включая Python/Bash, пакетную обработку больших библиотек соединений, параллельные вычисления, обработку ошибок, логирование и сохранение промежуточных результатов; 8. опыт работы в Linux/Unix: управление процессами и файлами, работа с удалёнными вычислительными ресурсами и базовые принципы организации вычислений.

41 712 руб.

1.0

12 514 руб.

8 342 руб.

0 руб.

качество выполняемых исследований («уровень» публикации или патентование результата, в том числе за рубежом)
ценность и востребованность результата (высокий объем цитирований, лицензирование прав на результат)
организация и «запуск» новых научных или научно-технических проектов
высокая результативность работы (вклад в результативность организации)

ежегодный основной отпуск

Белякова Алла Владимировна

belyakova_av@chumakovs.su

8 (495) 841-90-64 (4819)

Для участия в конкурсе на замещение вакантной должности, претендент должен предоставить в конкурсную комиссию полный перечень документов, отраженных в объявлении на официальном сайте организации в разделе "Вакансии" (отделение науки).