Вакансия ID VAC_155966
Разрабатывать методики решения отдельных задач исследования
Решать отдельные задачи исследования в качестве ответственного исполнителя
Оценивать степень решения отдельных задач исследования
Требования к кандидату
1. Опыт работы с вирусами второй группы патогенности, а также знание СанПин по работе со 2-ой и 3-ей группами патогенности; 2. Владение молекулярно-биологическими методами (проведение ПЦР; разработка праймеров для ОТ-ПЦР; обратная транскрипция для синтеза кДНК из РНК; выделение вирусной РНК из вирус содержащей жидкости методом осаждения; лигирование, рестрикция (включая подбор ферментов и анализ результатов); электрофорез в агарозном и полиакриламидном гелях с последующим анализом в гель-документирующем оборудовании; выделение плазмидной ДНК из бактериальных культур, контроль чистоты и концентрации; трансформация бактерий, подбор оптимальных условий; культивирование бактерий (штаммы E. coli и др.) на различных средах (LB, SOB, TB и др.) с контролем роста; подбор условий экспрессии рекомбинантных белков в бактериальной системе (штаммы E. coli); выделение и очистка рекомбинантных белков из культуральной жидкости (очистка методом аффинной хроматографии с использованием центрифужных фильтров для доп. очистки элюата, диализ); БСА- анализ; Western blot с последующим анализом результатов; иммуноферментный анализ с последующим анализом результатов; пробоподготовка для секвенирования методом Сенгера и NGS. 3. Владение вирусологическими методами (выделение вирусов 2-ой группы патогенности из клинических и лабораторных образцов; заражение клеточных культур вирусами 2-ой группы патогенности, мониторинг цитопатического эффекта; титрование вирусов методом бляшек с фиксацией и без фиксации; титрование вирусов методом TCID50; пассирование вирусов 2-ой группы патогенности для адаптации к клеточным линиям; клонирование методом негативных колоний вирусов 2-ой группы патогенности; реакция нейтрализации; получение фенотипически гомогенных вариантов вируса из фенотипически гетерогенных изолятов). 4. Биоинформатический анализ геномных последовательностей: - полученных методом секвенирования по Сенгеру (выравнивание, поиск консервативных доменов, филогенетический анализ); - биоинформатический анализ исходных NGS данных, знание языка bash, владение минимальным набором программ: Trimmomatic, BWA, Freebayes, EMBOSS. 5. Статистический анализ и оформление данных с использованием программного обеспечения GraphPad Prism. 6. Построение выравниваний и филогенетических деревьев с использованием программного обеспечения MEGA. 7. Знание клеточных технологий: культивирование клеточных линий (Vero, HEK293, и др.), контроль морфологии и пролиферации; подсчет клеток с использованием автоматических счетчиков; разморозка и заморозка клеточных культур. 8. Приготовление питательных сред и буферных растворов (TBE, PBS, LB и др.). 9. Научные публикации в области изучения вирусологии (опыт практической работы не менее 5 лет).
Заработная плата
ценность и востребованность результата (высокий объем цитирований, лицензирование прав на результат)
высокая результативность работы (вклад в результативность организации)
Социальный пакет
Контактная информация
Для участия в конкурсе на замещение вакантной должности, претендент должен предоставить в конкурсную комиссию полный перечень документов, отраженных в объявлении на официальном сайте организации в разделе "Вакансии" (отделение науки).
