в Лаборатории стабильности хромосом и микроэволюции генома

Изучение молекулярных механизмов элиминации генома у клональных позвоночных животных

1.Выявление цитогенетических механизмов элиминации генома у полуклональных видов амфибий. 2. Выявление молекулярно-генетической структуры полуклональных видов амфибий, включая геномные исследования, выполненные на базе высокопроизводительного секвенирования нового поколения. 3. Определение вклада генетической изменчивости родительских видов амфибий в особенности элиминации генетического материала у гибридов. 4. Цитометрические исследования (размер генома) амфибий и выявление связи с генетической изменчивостью. 5. Транскриптомика развивающихся гонад и выявление дифференциальной экспрессии генов с целью выяснения молекулярных механизмов элиминации генетического материала в клетках зародышевой линии амфибий.

1. Стандартные молекулярно-генетические методы: выделение ДНК и РНК, определение концентрации ДНК, разработка праймеров, в том числе для мультипраймерных систем; проведение ПЦР, мультиплексной ПЦР, ПЦР в реальном времени, гель-электрофорез в ПААГ, агарозном геле, очистка продуктов амплификации для последующего секвенирования. 2. Биоинформатическая обработка результатов NGS секвенирования, проверка качества ридов, сборка и аннотация геномов, построение филогении. 3. Статистический анализ и визуализация результатов в R, методы бутстрэпа и численного ресамплинга. 4. Проведение флуоресцентной in situ гибридизации, построение 3D визуализации с использованием результатов конфокальной микроскопии. 5. Флуоресцентная микроскопия (в том числе, конфокальная микроскопия гонад головастиков). 5. Английский язык – свободное чтение литературы и общение на профессиональные темы, представление данных в международные журналы и международные конференции.