Вакансия ID VAC_106715
Требования к кандидату
Дополнительные требования: Требуется научный сотрудник для реализации проектов в области молекулярной генетики и клеточной биологии, который имеет опыт работы в области молекулярной биологии: 1. За последние 3 года не менее 3 публикаций в области природоохранной, популяционной и сравнительной геномики в журналах, индексируемых Scopus или WoS, из них не менее 1 публикации в издании, входящем в первый квартиль, и не менее 2 публикаций, входящих во второй квартиль (Q1 и Q2; https://www.scimagojr.com/); 2. Опыт работы в области биоинформатики: - Создание и ручная коррекция de novo геномных сборок млекопитающих хромосомного уровня; - Улучшение сборок геномов скаффолдного уровня до хромосомного уровня с использованием данных HiC-секвенирования; - Оценка качества и аннотация сборок геномов млекопитающих; - Филогенетический анализ на полногеномном уровне; - Оценка качества и фильтрация полногеномных данных высокопроизводительного секвенирования; - Оценка покрытия и размера геномов млекопитающих по распределению k-меров в полногеномных данных секвенирования; - Сборка de novo и аннотация геномных повторов в полногеномных прочтениях; - Поиск и аннотация повторов в геномных сборках; - Выравнивание полногеномных прочтений и оценка покрытия геномных сборок; - Поиск и фильтрация генетических вариантов и оценка генетического разнообразия с определением уровня гетерозиготности; - Анализ популяционной структуры и определение уровня смешения близкородственных видов млекопитающих; - Поиск, сборка и аннотация митохондриальных прочтений из полногеномных данных; - Построение сетей гаплотипов с использованием ядерных и митохондриальных маркеров; - Реконструкция популяционной истории млекопитающих с использованием методов последовательной Марковской коалесценции; - Пространственно-временное моделирование экологических ниш млекопитающих; - Создание высокоэффективных программных конвейеров для автоматизации анализа больших наборов данных; - Опыт работы на высокопроизводительном вычислительном кластере. 3. Опыт участия в качестве исполнителя в грантах РФФИ/РНФ (не менее 2); 4. Опыт написания научных статей и отчетов по гранту; 5. Опыт представления результатов на международных научных конференциях (не менее 2 за последние 3 года).
